Entre a queda do xogunato e a ascensão da Era Meiji, uma poderosa luz brilhante emitida por uma varinha põe fim ao longo período Edo, evitando mais derramamento de sangue, à medida que o Japão inicia a sua transição para uma nova era. Neste contexto, Izou, um ronin errante de um só olho, que perdeu a razão de viver, e Raiden, um orc que detesta assassinatos e anseia por deixar a vida de roubo, encontram, cada um à sua maneira, uma jovem elfa chamada Sonya. Juntos, partem numa viagem pela estrada Tokaido para a levar, juntamente com a varinha que ela transporta, em segurança até à terra dos elfos, no norte. No seu caminho, surge a misteriosa organização Inferni, que ambiciona obter a varinha e ressuscitar o Lorde das Trevas, que pretende governar toda a criação. A Inferni também se aproveita do novo governo Meiji na sua tentativa de roubar a varinha de Izou, Raiden e Sonya. Viajando pela estrada Tokaido, de Quioto a Yokohama, Izou e Raiden iniciam a sua viagem para proteger a varinha.